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解决移动PCR实验室检测被污染的方法
移动PCR实验室具有扩增量大、灵敏度高的特点,但令人头疼的是容易污染,极少量的污染就能造成假阳性。面对样品交叉污染、试剂仪器交叉污染、克隆质粒污染、聚合酶链反应扩增产物污染、容易被忽视的气溶胶污染等众多污染源,气溶胶是由固体或液体小颗粒分散悬浮在气体介质中形成的胶体分散体系。当空气和液体表面发生摩擦时,如操作时剧烈摇动反应管,打开盖子,吸取样品,用污染注射枪反复吸取样品,气溶胶会形成污染。这样的污染悄无声息,难以防范。
虽然这些污染对聚合酶链反应实验结果的影响已经受到广泛关注,但大多数移动聚合酶链反应实验室都采用了各种污染控制方法,如定期清洗、划分操作区域、试剂包装、精心操作、重复实验和多角度验证结果。而少量的核酸片段可以被扩增出来,因此污染物的控制不仅可以通过这样做来消除和避免,还可以从源头上消除和避免。
目前大多数生物实验室每天都在大规模进行分子实验。污染源无处不在,有特异性的,有非特异性的,有同源的,有非同源的,广泛分布在样品容器,实验室台面,试剂溶液,附着在仪器表面的试管等。以下是为消除这些污染源而开发的方法:
1.用酒精擦拭:沉淀核酸,擦拭后确保被污染表面的污染得到一定程度的缓解(简便、成本低)。
2.修饰:标记遗传物质,防止聚合酶和核酸结合,从而抑制DNA的扩散(效果比较好)。
3.酶解:酶可以将长链核酸分子降解成小片段(速度快,效果相对较好)。
4.高压变性:高压可以将核酸降解成20-30bp的小片段(彻底,成本低)。
5.紫外线照射:PCR产物中的嘧啶碱基会形成二聚体,延伸终止(方便、范围广、成本低)。
有实验室的地方,必然会有实验室污染。实验室污染不仅会影响实验和科研的质量和效果,还会损害实验室工作人员的健康。一个好的移动PCR实验室要时刻注意污染的监测,考虑是什么原因造成污染,从而采取措施预防和消除污染。
上一条: 移动PCR实验室的布局与设计要点
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